Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930467E23RikD3Z1P8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms