Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC048679D3YXE9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BC048679D3YXE9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms