Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD8

Mfap1a, Microfibrillar-associated protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1aC0HKD8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mfap1aC0HKD8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mfap1aC0HKD8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms