Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Cttnbp2B9EJA2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Cttnbp2B9EJA2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cttnbp2B9EJA2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cttnbp2B9EJA2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cttnbp2B9EJA2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cttnbp2B9EJA2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cttnbp2B9EJA2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cttnbp2B9EJA2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cttnbp2B9EJA2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cttnbp2B9EJA2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cttnbp2B9EJA2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cttnbp2B9EJA2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cttnbp2B9EJA2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cttnbp2B9EJA2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms