Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cfap58B2RW38 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap58B2RW38 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms