Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ankrd34aB2RW11 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ankrd34aB2RW11 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd34aB2RW11 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms