Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rd3lB2RV38 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rd3lB2RV38 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms