Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Abcc8B2RUS7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Abcc8B2RUS7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Abcc8B2RUS7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Abcc8B2RUS7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
Abcc8B2RUS7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
Abcc8B2RUS7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Abcc8B2RUS7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Abcc8B2RUS7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Abcc8B2RUS7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Abcc8B2RUS7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Abcc8B2RUS7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.35
Abcc8B2RUS7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Abcc8B2RUS7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.33
Abcc8B2RUS7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.07■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Abcc8B2RUS7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Abcc8B2RUS7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
Abcc8B2RUS7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Abcc8B2RUS7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Abcc8B2RUS7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Abcc8B2RUS7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Abcc8B2RUS7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Abcc8B2RUS7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Abcc8B2RUS7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Abcc8B2RUS7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Abcc8B2RUS7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Abcc8B2RUS7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Abcc8B2RUS7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Abcc8B2RUS7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms