Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apol7aB2RT54 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apol7aB2RT54 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms