Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930435E12RikA6X8Z9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms