Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc38A3KMP2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc38A3KMP2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc38A3KMP2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms