Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CatsperbA2RTF1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CatsperbA2RTF1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CatsperbA2RTF1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms