Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Samt1A2BED8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samt1A2BED8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms