Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klhl41A2AUC9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl41A2AUC9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl41A2AUC9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms