Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn3aA2ASI5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn3aA2ASI5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn3aA2ASI5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms