Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rtf1A2AQ19 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rtf1A2AQ19 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rtf1A2AQ19 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
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