Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn1aA2APX8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scn1aA2APX8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scn1aA2APX8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn1aA2APX8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn1aA2APX8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn1aA2APX8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn1aA2APX8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn1aA2APX8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn1aA2APX8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Scn1aA2APX8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scn1aA2APX8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scn1aA2APX8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Scn1aA2APX8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms