Protein–RNA interactions for Protein: A2APU8

Fam205a, Protein FAM205A, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam205aA2APU8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Fam205aA2APU8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fam205aA2APU8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam205aA2APU8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms