Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syndig1A2ANU3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syndig1A2ANU3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms