Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox3fA2ANE1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox3fA2ANE1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms