Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn34c4A2ANA3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms