Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Lcn6A2AJB9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Lcn6A2AJB9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Lcn6A2AJB9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Lcn6A2AJB9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lcn6A2AJB9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Lcn6A2AJB9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Lcn6A2AJB9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Lcn6A2AJB9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Lcn6A2AJB9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Lcn6A2AJB9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lcn6A2AJB9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.2 ms