Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm12A2AJ77 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm12A2AJ77 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm12A2AJ77 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm12A2AJ77 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms