Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rhbdl2A2AGA4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhbdl2A2AGA4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms