Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbbp8nlA2ABX0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rbbp8nlA2ABX0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms