Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisal2aA2A9G7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Shisal2aA2A9G7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shisal2aA2A9G7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.2 ms