Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hivep3A2A884 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hivep3A2A884 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms