Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnf19bA2A7Q9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf19bA2A7Q9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms