Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms