Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms