Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H9

Igkv1-132, Immunoglobulin kappa variable 1-132 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igkv1-132A0A0B4J1H9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms