Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm28360A0A087WR25 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm28360A0A087WR25 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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