Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ89

2210011C24Rik, MCG5930, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2210011C24RikA0A087WQ89 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
2210011C24RikA0A087WQ89 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
2210011C24RikA0A087WQ89 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms