Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm28171A0A087WQ19 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm28171A0A087WQ19 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28171A0A087WQ19 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms