Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPJ1

1700017N19Rik, RIKEN cDNA 1700017N19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700017N19RikA0A087WPJ1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700017N19RikA0A087WPJ1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700017N19RikA0A087WPJ1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700017N19RikA0A087WPJ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700017N19RikA0A087WPJ1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700017N19RikA0A087WPJ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700017N19RikA0A087WPJ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700017N19RikA0A087WPJ1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700017N19RikA0A087WPJ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700017N19RikA0A087WPJ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700017N19RikA0A087WPJ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700017N19RikA0A087WPJ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700017N19RikA0A087WPJ1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700017N19RikA0A087WPJ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700017N19RikA0A087WPJ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700017N19RikA0A087WPJ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms