Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP46

BC034090, cDNA sequence BC034090, mousemouse

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC034090A0A087WP46 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BC034090A0A087WP46 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BC034090A0A087WP46 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms