Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm28510A0A087WP28 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Gm28510A0A087WP28 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Gm28510A0A087WP28 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Gm28510A0A087WP28 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Gm28510A0A087WP28 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Gm28510A0A087WP28 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Gm28510A0A087WP28 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Gm28510A0A087WP28 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Gm28510A0A087WP28 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Gm28510A0A087WP28 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm28510A0A087WP28 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm28510A0A087WP28 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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