Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
CcniQ9Z2V9 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CcniQ9Z2V9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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