Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Upk1bQ9Z2C6 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Upk1bQ9Z2C6 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Upk1bQ9Z2C6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Upk1bQ9Z2C6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Upk1bQ9Z2C6 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Upk1bQ9Z2C6 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Upk1bQ9Z2C6 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Upk1bQ9Z2C6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Upk1bQ9Z2C6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Upk1bQ9Z2C6 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Upk1bQ9Z2C6 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Upk1bQ9Z2C6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Upk1bQ9Z2C6 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Upk1bQ9Z2C6 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Upk1bQ9Z2C6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms