Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cldn8Q9Z260 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn8Q9Z260 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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