Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Kcnip3Q9QXT8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms