Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sall2Q9QX96 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms