Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Nectin1Q9JKF6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Nectin1Q9JKF6 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Nectin1Q9JKF6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Nectin1Q9JKF6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Nectin1Q9JKF6 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nectin1Q9JKF6 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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