Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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Trim39Q9ESN2 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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