Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms