Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Pramef12Q9D2F1 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Pramef12Q9D2F1 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Pramef12Q9D2F1 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Pramef12Q9D2F1 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Pramef12Q9D2F1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Pramef12Q9D2F1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Pramef12Q9D2F1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pramef12Q9D2F1 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms