Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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