Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NubplQ9CWD8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms