Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp16Q99LG0 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms