Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlgn1Q99K10 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlgn1Q99K10 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlgn1Q99K10 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlgn1Q99K10 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlgn1Q99K10 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlgn1Q99K10 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlgn1Q99K10 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlgn1Q99K10 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nlgn1Q99K10 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nlgn1Q99K10 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nlgn1Q99K10 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlgn1Q99K10 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms